Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LTBP4Q8N2S1 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LTBP4Q8N2S1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LTBP4Q8N2S1 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LTBP4Q8N2S1 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LTBP4Q8N2S1 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LTBP4Q8N2S1 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LTBP4Q8N2S1 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LTBP4Q8N2S1 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LTBP4Q8N2S1 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LTBP4Q8N2S1 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
LTBP4Q8N2S1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LTBP4Q8N2S1 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LTBP4Q8N2S1 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LTBP4Q8N2S1 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LTBP4Q8N2S1 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LTBP4Q8N2S1 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LTBP4Q8N2S1 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
LTBP4Q8N2S1 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LTBP4Q8N2S1 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LTBP4Q8N2S1 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LTBP4Q8N2S1 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LTBP4Q8N2S1 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LTBP4Q8N2S1 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LTBP4Q8N2S1 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LTBP4Q8N2S1 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LTBP4Q8N2S1 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LTBP4Q8N2S1 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LTBP4Q8N2S1 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LTBP4Q8N2S1 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
LTBP4Q8N2S1 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LTBP4Q8N2S1 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LTBP4Q8N2S1 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LTBP4Q8N2S1 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LTBP4Q8N2S1 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LTBP4Q8N2S1 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LTBP4Q8N2S1 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LTBP4Q8N2S1 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
LTBP4Q8N2S1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LTBP4Q8N2S1 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LTBP4Q8N2S1 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
LTBP4Q8N2S1 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LTBP4Q8N2S1 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LTBP4Q8N2S1 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
LTBP4Q8N2S1 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LTBP4Q8N2S1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LTBP4Q8N2S1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LTBP4Q8N2S1 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LTBP4Q8N2S1 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LTBP4Q8N2S1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LTBP4Q8N2S1 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LTBP4Q8N2S1 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LTBP4Q8N2S1 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LTBP4Q8N2S1 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LTBP4Q8N2S1 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LTBP4Q8N2S1 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LTBP4Q8N2S1 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LTBP4Q8N2S1 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LTBP4Q8N2S1 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LTBP4Q8N2S1 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LTBP4Q8N2S1 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
LTBP4Q8N2S1 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
LTBP4Q8N2S1 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LTBP4Q8N2S1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LTBP4Q8N2S1 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LTBP4Q8N2S1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LTBP4Q8N2S1 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LTBP4Q8N2S1 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LTBP4Q8N2S1 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LTBP4Q8N2S1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LTBP4Q8N2S1 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
LTBP4Q8N2S1 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LTBP4Q8N2S1 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LTBP4Q8N2S1 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LTBP4Q8N2S1 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
LTBP4Q8N2S1 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
LTBP4Q8N2S1 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LTBP4Q8N2S1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LTBP4Q8N2S1 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LTBP4Q8N2S1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LTBP4Q8N2S1 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LTBP4Q8N2S1 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LTBP4Q8N2S1 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LTBP4Q8N2S1 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
LTBP4Q8N2S1 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LTBP4Q8N2S1 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LTBP4Q8N2S1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LTBP4Q8N2S1 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LTBP4Q8N2S1 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LTBP4Q8N2S1 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LTBP4Q8N2S1 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LTBP4Q8N2S1 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LTBP4Q8N2S1 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LTBP4Q8N2S1 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LTBP4Q8N2S1 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LTBP4Q8N2S1 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LTBP4Q8N2S1 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LTBP4Q8N2S1 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LTBP4Q8N2S1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LTBP4Q8N2S1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms