Protein–RNA interactions for Protein: Q86VQ6

TXNRD3, Thioredoxin reductase 3, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD3Q86VQ6 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TXNRD3Q86VQ6 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms