Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z404

TMC4, Transmembrane channel-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC4Q7Z404 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMC4Q7Z404 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMC4Q7Z404 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms