Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC26■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms