Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
OTOP1Q7RTM1 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms