Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQX7

LIAT1, Protein LIAT1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIAT1Q6ZQX7 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 UBE2Q2P6-202ENST00000617217 443 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
LIAT1Q6ZQX7 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 LINC00437-201ENST00000414161 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LIAT1Q6ZQX7 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms