Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
TMIGD1Q6UXZ0 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMIGD1Q6UXZ0 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMIGD1Q6UXZ0 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMIGD1Q6UXZ0 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMIGD1Q6UXZ0 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMIGD1Q6UXZ0 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMIGD1Q6UXZ0 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMIGD1Q6UXZ0 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMIGD1Q6UXZ0 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMIGD1Q6UXZ0 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMIGD1Q6UXZ0 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMIGD1Q6UXZ0 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMIGD1Q6UXZ0 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMIGD1Q6UXZ0 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMIGD1Q6UXZ0 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMIGD1Q6UXZ0 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMIGD1Q6UXZ0 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMIGD1Q6UXZ0 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMIGD1Q6UXZ0 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMIGD1Q6UXZ0 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMIGD1Q6UXZ0 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TMIGD1Q6UXZ0 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMIGD1Q6UXZ0 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMIGD1Q6UXZ0 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMIGD1Q6UXZ0 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMIGD1Q6UXZ0 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMIGD1Q6UXZ0 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMIGD1Q6UXZ0 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMIGD1Q6UXZ0 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMIGD1Q6UXZ0 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMIGD1Q6UXZ0 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMIGD1Q6UXZ0 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMIGD1Q6UXZ0 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMIGD1Q6UXZ0 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIGD1Q6UXZ0 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIGD1Q6UXZ0 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIGD1Q6UXZ0 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIGD1Q6UXZ0 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIGD1Q6UXZ0 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIGD1Q6UXZ0 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIGD1Q6UXZ0 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIGD1Q6UXZ0 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIGD1Q6UXZ0 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIGD1Q6UXZ0 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIGD1Q6UXZ0 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIGD1Q6UXZ0 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIGD1Q6UXZ0 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIGD1Q6UXZ0 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIGD1Q6UXZ0 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIGD1Q6UXZ0 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIGD1Q6UXZ0 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIGD1Q6UXZ0 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIGD1Q6UXZ0 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIGD1Q6UXZ0 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIGD1Q6UXZ0 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIGD1Q6UXZ0 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIGD1Q6UXZ0 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIGD1Q6UXZ0 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIGD1Q6UXZ0 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIGD1Q6UXZ0 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIGD1Q6UXZ0 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIGD1Q6UXZ0 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIGD1Q6UXZ0 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIGD1Q6UXZ0 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIGD1Q6UXZ0 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIGD1Q6UXZ0 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMIGD1Q6UXZ0 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMIGD1Q6UXZ0 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMIGD1Q6UXZ0 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TMIGD1Q6UXZ0 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMIGD1Q6UXZ0 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMIGD1Q6UXZ0 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMIGD1Q6UXZ0 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMIGD1Q6UXZ0 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMIGD1Q6UXZ0 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMIGD1Q6UXZ0 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMIGD1Q6UXZ0 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMIGD1Q6UXZ0 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TMIGD1Q6UXZ0 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMIGD1Q6UXZ0 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMIGD1Q6UXZ0 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMIGD1Q6UXZ0 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMIGD1Q6UXZ0 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMIGD1Q6UXZ0 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMIGD1Q6UXZ0 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMIGD1Q6UXZ0 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMIGD1Q6UXZ0 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMIGD1Q6UXZ0 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMIGD1Q6UXZ0 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMIGD1Q6UXZ0 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMIGD1Q6UXZ0 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMIGD1Q6UXZ0 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMIGD1Q6UXZ0 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMIGD1Q6UXZ0 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMIGD1Q6UXZ0 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMIGD1Q6UXZ0 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms