Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMBR1LQ6UX01 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMBR1LQ6UX01 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMBR1LQ6UX01 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMBR1LQ6UX01 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMBR1LQ6UX01 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMBR1LQ6UX01 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMBR1LQ6UX01 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMBR1LQ6UX01 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMBR1LQ6UX01 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMBR1LQ6UX01 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMBR1LQ6UX01 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
LMBR1LQ6UX01 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
LMBR1LQ6UX01 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMBR1LQ6UX01 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMBR1LQ6UX01 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMBR1LQ6UX01 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMBR1LQ6UX01 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMBR1LQ6UX01 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMBR1LQ6UX01 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMBR1LQ6UX01 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMBR1LQ6UX01 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMBR1LQ6UX01 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMBR1LQ6UX01 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMBR1LQ6UX01 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMBR1LQ6UX01 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMBR1LQ6UX01 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMBR1LQ6UX01 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMBR1LQ6UX01 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMBR1LQ6UX01 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMBR1LQ6UX01 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMBR1LQ6UX01 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
LMBR1LQ6UX01 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMBR1LQ6UX01 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMBR1LQ6UX01 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMBR1LQ6UX01 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMBR1LQ6UX01 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms