Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL35Q6PF15 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms