Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD62

CTR9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTR9Q6PD62 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTR9Q6PD62 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTR9Q6PD62 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms