Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2S7

TTC41P, Putative tetratricopeptide repeat protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC41PQ6P2S7 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTC41PQ6P2S7 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTC41PQ6P2S7 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms