Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXP0

EFCAB12, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB12Q6NXP0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EFCAB12Q6NXP0 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms