Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW40

RGMB, RGM domain family member B, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMBQ6NW40 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RGMBQ6NW40 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGMBQ6NW40 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms