Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RCSD1Q6JBY9 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms