Protein–RNA interactions for Protein: Q685J3

MUC17, Mucin-17, humanhuman

Predictions only

Length 4,493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC17Q685J3 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC10.11□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.8 ms