Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV63

ATRNL1, Attractin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRNL1Q5VV63 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATRNL1Q5VV63 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATRNL1Q5VV63 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ATRNL1Q5VV63 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATRNL1Q5VV63 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATRNL1Q5VV63 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATRNL1Q5VV63 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATRNL1Q5VV63 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATRNL1Q5VV63 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATRNL1Q5VV63 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATRNL1Q5VV63 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATRNL1Q5VV63 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATRNL1Q5VV63 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ATRNL1Q5VV63 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ATRNL1Q5VV63 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATRNL1Q5VV63 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATRNL1Q5VV63 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATRNL1Q5VV63 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATRNL1Q5VV63 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATRNL1Q5VV63 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATRNL1Q5VV63 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ATRNL1Q5VV63 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATRNL1Q5VV63 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ATRNL1Q5VV63 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ATRNL1Q5VV63 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATRNL1Q5VV63 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATRNL1Q5VV63 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATRNL1Q5VV63 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATRNL1Q5VV63 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATRNL1Q5VV63 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ATRNL1Q5VV63 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATRNL1Q5VV63 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms