Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTB9

RNF220, E3 ubiquitin-protein ligase RNF220, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF220Q5VTB9 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNF220Q5VTB9 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNF220Q5VTB9 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RNF220Q5VTB9 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNF220Q5VTB9 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNF220Q5VTB9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNF220Q5VTB9 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RNF220Q5VTB9 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNF220Q5VTB9 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RNF220Q5VTB9 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNF220Q5VTB9 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNF220Q5VTB9 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNF220Q5VTB9 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNF220Q5VTB9 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNF220Q5VTB9 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNF220Q5VTB9 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF220Q5VTB9 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF220Q5VTB9 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF220Q5VTB9 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF220Q5VTB9 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF220Q5VTB9 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF220Q5VTB9 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF220Q5VTB9 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF220Q5VTB9 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF220Q5VTB9 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF220Q5VTB9 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF220Q5VTB9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF220Q5VTB9 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF220Q5VTB9 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF220Q5VTB9 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF220Q5VTB9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF220Q5VTB9 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF220Q5VTB9 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF220Q5VTB9 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF220Q5VTB9 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF220Q5VTB9 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF220Q5VTB9 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF220Q5VTB9 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF220Q5VTB9 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF220Q5VTB9 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF220Q5VTB9 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF220Q5VTB9 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF220Q5VTB9 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF220Q5VTB9 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNF220Q5VTB9 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNF220Q5VTB9 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNF220Q5VTB9 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNF220Q5VTB9 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNF220Q5VTB9 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNF220Q5VTB9 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNF220Q5VTB9 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNF220Q5VTB9 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNF220Q5VTB9 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNF220Q5VTB9 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RNF220Q5VTB9 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNF220Q5VTB9 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNF220Q5VTB9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNF220Q5VTB9 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNF220Q5VTB9 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNF220Q5VTB9 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNF220Q5VTB9 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNF220Q5VTB9 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNF220Q5VTB9 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNF220Q5VTB9 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNF220Q5VTB9 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNF220Q5VTB9 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNF220Q5VTB9 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RNF220Q5VTB9 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNF220Q5VTB9 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNF220Q5VTB9 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNF220Q5VTB9 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNF220Q5VTB9 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNF220Q5VTB9 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNF220Q5VTB9 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNF220Q5VTB9 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNF220Q5VTB9 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNF220Q5VTB9 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNF220Q5VTB9 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNF220Q5VTB9 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNF220Q5VTB9 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNF220Q5VTB9 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNF220Q5VTB9 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNF220Q5VTB9 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNF220Q5VTB9 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNF220Q5VTB9 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RNF220Q5VTB9 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RNF220Q5VTB9 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RNF220Q5VTB9 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RNF220Q5VTB9 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RNF220Q5VTB9 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RNF220Q5VTB9 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RNF220Q5VTB9 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RNF220Q5VTB9 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RNF220Q5VTB9 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RNF220Q5VTB9 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RNF220Q5VTB9 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RNF220Q5VTB9 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RNF220Q5VTB9 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RNF220Q5VTB9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RNF220Q5VTB9 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms