Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LDLRAP1Q5SW96 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LDLRAP1Q5SW96 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms