Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms