Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PKDCCQ504Y2 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKDCCQ504Y2 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms