Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms