Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
NBPF1Q3BBV0 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NBPF1Q3BBV0 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NBPF1Q3BBV0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NBPF1Q3BBV0 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NBPF1Q3BBV0 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NBPF1Q3BBV0 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NBPF1Q3BBV0 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NBPF1Q3BBV0 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NBPF1Q3BBV0 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
NBPF1Q3BBV0 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NBPF1Q3BBV0 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NBPF1Q3BBV0 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NBPF1Q3BBV0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NBPF1Q3BBV0 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NBPF1Q3BBV0 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NBPF1Q3BBV0 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NBPF1Q3BBV0 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NBPF1Q3BBV0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NBPF1Q3BBV0 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NBPF1Q3BBV0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NBPF1Q3BBV0 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NBPF1Q3BBV0 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NBPF1Q3BBV0 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NBPF1Q3BBV0 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NBPF1Q3BBV0 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC27■■□□□ 1.91
NBPF1Q3BBV0 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NBPF1Q3BBV0 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
NBPF1Q3BBV0 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NBPF1Q3BBV0 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NBPF1Q3BBV0 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms