Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHR3

QSER1, Glutamine and serine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
QSER1Q2KHR3 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
QSER1Q2KHR3 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
QSER1Q2KHR3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
QSER1Q2KHR3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
QSER1Q2KHR3 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
QSER1Q2KHR3 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
QSER1Q2KHR3 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
QSER1Q2KHR3 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
QSER1Q2KHR3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
QSER1Q2KHR3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
QSER1Q2KHR3 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
QSER1Q2KHR3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
QSER1Q2KHR3 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
QSER1Q2KHR3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
QSER1Q2KHR3 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
QSER1Q2KHR3 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
QSER1Q2KHR3 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
QSER1Q2KHR3 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
QSER1Q2KHR3 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
QSER1Q2KHR3 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
QSER1Q2KHR3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
QSER1Q2KHR3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
QSER1Q2KHR3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
QSER1Q2KHR3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
QSER1Q2KHR3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
QSER1Q2KHR3 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
QSER1Q2KHR3 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
QSER1Q2KHR3 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
QSER1Q2KHR3 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
QSER1Q2KHR3 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
QSER1Q2KHR3 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
QSER1Q2KHR3 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
QSER1Q2KHR3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
QSER1Q2KHR3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
QSER1Q2KHR3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
QSER1Q2KHR3 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
QSER1Q2KHR3 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
QSER1Q2KHR3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
QSER1Q2KHR3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
QSER1Q2KHR3 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
QSER1Q2KHR3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
QSER1Q2KHR3 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
QSER1Q2KHR3 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
QSER1Q2KHR3 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
QSER1Q2KHR3 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
QSER1Q2KHR3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
QSER1Q2KHR3 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
QSER1Q2KHR3 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
QSER1Q2KHR3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
QSER1Q2KHR3 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
QSER1Q2KHR3 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
QSER1Q2KHR3 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
QSER1Q2KHR3 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
QSER1Q2KHR3 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
QSER1Q2KHR3 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
QSER1Q2KHR3 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
QSER1Q2KHR3 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
QSER1Q2KHR3 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
QSER1Q2KHR3 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
QSER1Q2KHR3 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
QSER1Q2KHR3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
QSER1Q2KHR3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
QSER1Q2KHR3 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
QSER1Q2KHR3 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
QSER1Q2KHR3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
QSER1Q2KHR3 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
QSER1Q2KHR3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
QSER1Q2KHR3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
QSER1Q2KHR3 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
QSER1Q2KHR3 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
QSER1Q2KHR3 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
QSER1Q2KHR3 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
QSER1Q2KHR3 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
QSER1Q2KHR3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
QSER1Q2KHR3 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
QSER1Q2KHR3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
QSER1Q2KHR3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
QSER1Q2KHR3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
QSER1Q2KHR3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
QSER1Q2KHR3 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
QSER1Q2KHR3 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
QSER1Q2KHR3 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
QSER1Q2KHR3 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
QSER1Q2KHR3 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
QSER1Q2KHR3 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
QSER1Q2KHR3 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
QSER1Q2KHR3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
QSER1Q2KHR3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
QSER1Q2KHR3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
QSER1Q2KHR3 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
QSER1Q2KHR3 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
QSER1Q2KHR3 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
QSER1Q2KHR3 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
QSER1Q2KHR3 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
QSER1Q2KHR3 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
QSER1Q2KHR3 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
QSER1Q2KHR3 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
QSER1Q2KHR3 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
QSER1Q2KHR3 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
QSER1Q2KHR3 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms