Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
COL24A1Q17RW2 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms