Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLPPQ16740 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
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