Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CDKN3Q16667 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
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