Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECM1Q16610 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECM1Q16610 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECM1Q16610 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECM1Q16610 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECM1Q16610 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECM1Q16610 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECM1Q16610 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECM1Q16610 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECM1Q16610 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECM1Q16610 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECM1Q16610 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECM1Q16610 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECM1Q16610 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECM1Q16610 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECM1Q16610 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECM1Q16610 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECM1Q16610 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECM1Q16610 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECM1Q16610 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECM1Q16610 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECM1Q16610 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECM1Q16610 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECM1Q16610 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECM1Q16610 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECM1Q16610 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ECM1Q16610 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECM1Q16610 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECM1Q16610 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECM1Q16610 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECM1Q16610 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECM1Q16610 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECM1Q16610 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECM1Q16610 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECM1Q16610 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECM1Q16610 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECM1Q16610 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECM1Q16610 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECM1Q16610 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECM1Q16610 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECM1Q16610 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECM1Q16610 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ECM1Q16610 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECM1Q16610 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECM1Q16610 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECM1Q16610 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECM1Q16610 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ECM1Q16610 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ECM1Q16610 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ECM1Q16610 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ECM1Q16610 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ECM1Q16610 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ECM1Q16610 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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