Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SGCBQ16585 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
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