Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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RPE65Q16518 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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RPE65Q16518 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
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RPE65Q16518 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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RPE65Q16518 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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RPE65Q16518 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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