Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZFHX3Q15911 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZFHX3Q15911 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZFHX3Q15911 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZFHX3Q15911 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZFHX3Q15911 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZFHX3Q15911 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZFHX3Q15911 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZFHX3Q15911 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZFHX3Q15911 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZFHX3Q15911 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZFHX3Q15911 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZFHX3Q15911 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZFHX3Q15911 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ZFHX3Q15911 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZFHX3Q15911 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ZFHX3Q15911 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZFHX3Q15911 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ZFHX3Q15911 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZFHX3Q15911 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ZFHX3Q15911 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZFHX3Q15911 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZFHX3Q15911 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZFHX3Q15911 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZFHX3Q15911 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZFHX3Q15911 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZFHX3Q15911 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZFHX3Q15911 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZFHX3Q15911 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZFHX3Q15911 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZFHX3Q15911 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZFHX3Q15911 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZFHX3Q15911 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZFHX3Q15911 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZFHX3Q15911 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZFHX3Q15911 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZFHX3Q15911 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZFHX3Q15911 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZFHX3Q15911 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZFHX3Q15911 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZFHX3Q15911 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ZFHX3Q15911 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZFHX3Q15911 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZFHX3Q15911 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZFHX3Q15911 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZFHX3Q15911 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZFHX3Q15911 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZFHX3Q15911 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZFHX3Q15911 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZFHX3Q15911 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZFHX3Q15911 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZFHX3Q15911 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ZFHX3Q15911 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZFHX3Q15911 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZFHX3Q15911 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZFHX3Q15911 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZFHX3Q15911 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZFHX3Q15911 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZFHX3Q15911 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZFHX3Q15911 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ZFHX3Q15911 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZFHX3Q15911 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ZFHX3Q15911 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZFHX3Q15911 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ZFHX3Q15911 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.14
ZFHX3Q15911 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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