Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
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NCOA1Q15788 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
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