Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
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LAPTM4AQ15012 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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LAPTM4AQ15012 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
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LAPTM4AQ15012 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LAPTM4AQ15012 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
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