Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBM39Q14498 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBM39Q14498 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBM39Q14498 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBM39Q14498 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBM39Q14498 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBM39Q14498 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBM39Q14498 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBM39Q14498 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBM39Q14498 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBM39Q14498 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBM39Q14498 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBM39Q14498 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBM39Q14498 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBM39Q14498 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBM39Q14498 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBM39Q14498 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBM39Q14498 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBM39Q14498 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBM39Q14498 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBM39Q14498 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBM39Q14498 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBM39Q14498 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBM39Q14498 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBM39Q14498 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBM39Q14498 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBM39Q14498 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBM39Q14498 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBM39Q14498 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RBM39Q14498 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBM39Q14498 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBM39Q14498 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBM39Q14498 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBM39Q14498 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBM39Q14498 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBM39Q14498 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBM39Q14498 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBM39Q14498 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBM39Q14498 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBM39Q14498 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBM39Q14498 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBM39Q14498 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBM39Q14498 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBM39Q14498 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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RBM39Q14498 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBM39Q14498 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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RBM39Q14498 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBM39Q14498 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBM39Q14498 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBM39Q14498 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBM39Q14498 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBM39Q14498 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBM39Q14498 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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RBM39Q14498 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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RBM39Q14498 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBM39Q14498 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBM39Q14498 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBM39Q14498 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
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RBM39Q14498 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBM39Q14498 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBM39Q14498 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBM39Q14498 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBM39Q14498 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBM39Q14498 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBM39Q14498 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBM39Q14498 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBM39Q14498 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RBM39Q14498 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RBM39Q14498 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBM39Q14498 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBM39Q14498 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBM39Q14498 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RBM39Q14498 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBM39Q14498 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBM39Q14498 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RBM39Q14498 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBM39Q14498 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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