Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCINQ13939 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCINQ13939 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCINQ13939 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCINQ13939 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCINQ13939 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCINQ13939 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCINQ13939 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCINQ13939 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCINQ13939 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CCINQ13939 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCINQ13939 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCINQ13939 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CCINQ13939 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCINQ13939 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCINQ13939 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCINQ13939 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCINQ13939 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCINQ13939 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCINQ13939 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCINQ13939 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCINQ13939 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCINQ13939 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCINQ13939 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCINQ13939 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCINQ13939 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCINQ13939 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCINQ13939 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCINQ13939 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCINQ13939 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCINQ13939 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCINQ13939 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCINQ13939 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCINQ13939 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCINQ13939 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCINQ13939 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCINQ13939 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCINQ13939 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCINQ13939 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCINQ13939 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCINQ13939 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCINQ13939 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCINQ13939 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCINQ13939 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CCINQ13939 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CCINQ13939 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCINQ13939 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCINQ13939 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCINQ13939 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCINQ13939 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCINQ13939 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCINQ13939 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCINQ13939 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCINQ13939 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCINQ13939 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCINQ13939 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCINQ13939 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCINQ13939 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCINQ13939 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCINQ13939 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCINQ13939 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCINQ13939 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCINQ13939 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCINQ13939 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCINQ13939 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
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CCINQ13939 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCINQ13939 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CCINQ13939 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCINQ13939 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCINQ13939 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CCINQ13939 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCINQ13939 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCINQ13939 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CCINQ13939 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCINQ13939 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCINQ13939 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCINQ13939 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCINQ13939 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCINQ13939 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCINQ13939 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCINQ13939 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCINQ13939 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCINQ13939 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCINQ13939 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCINQ13939 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCINQ13939 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCINQ13939 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCINQ13939 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCINQ13939 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCINQ13939 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCINQ13939 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCINQ13939 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCINQ13939 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCINQ13939 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCINQ13939 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCINQ13939 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCINQ13939 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CCINQ13939 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCINQ13939 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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