Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PEX6Q13608 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
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