Protein–RNA interactions for Protein: Q13557

CAMK2D, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2DQ13557 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAMK2DQ13557 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms