Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PICALMQ13492 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms