Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.78
XRCC4Q13426 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
XRCC4Q13426 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
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