Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
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ITGB3BPQ13352 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ITGB3BPQ13352 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ITGB3BPQ13352 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ITGB3BPQ13352 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
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ITGB3BPQ13352 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ITGB3BPQ13352 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ITGB3BPQ13352 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ITGB3BPQ13352 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ITGB3BPQ13352 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ITGB3BPQ13352 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGB3BPQ13352 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGB3BPQ13352 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGB3BPQ13352 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGB3BPQ13352 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
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ITGB3BPQ13352 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
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ITGB3BPQ13352 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGB3BPQ13352 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGB3BPQ13352 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGB3BPQ13352 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGB3BPQ13352 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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ITGB3BPQ13352 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
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ITGB3BPQ13352 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
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ITGB3BPQ13352 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGB3BPQ13352 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
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ITGB3BPQ13352 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGB3BPQ13352 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
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ITGB3BPQ13352 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGB3BPQ13352 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGB3BPQ13352 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGB3BPQ13352 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGB3BPQ13352 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
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ITGB3BPQ13352 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGB3BPQ13352 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGB3BPQ13352 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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ITGB3BPQ13352 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
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ITGB3BPQ13352 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGB3BPQ13352 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGB3BPQ13352 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
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ITGB3BPQ13352 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGB3BPQ13352 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGB3BPQ13352 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGB3BPQ13352 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGB3BPQ13352 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGB3BPQ13352 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGB3BPQ13352 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGB3BPQ13352 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGB3BPQ13352 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGB3BPQ13352 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGB3BPQ13352 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGB3BPQ13352 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGB3BPQ13352 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGB3BPQ13352 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGB3BPQ13352 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGB3BPQ13352 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGB3BPQ13352 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGB3BPQ13352 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGB3BPQ13352 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGB3BPQ13352 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGB3BPQ13352 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
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