Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCGB2A2Q13296 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCGB2A2Q13296 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCGB2A2Q13296 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCGB2A2Q13296 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCGB2A2Q13296 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SCGB2A2Q13296 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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SCGB2A2Q13296 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCGB2A2Q13296 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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SCGB2A2Q13296 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCGB2A2Q13296 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCGB2A2Q13296 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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SCGB2A2Q13296 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCGB2A2Q13296 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCGB2A2Q13296 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCGB2A2Q13296 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCGB2A2Q13296 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCGB2A2Q13296 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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SCGB2A2Q13296 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCGB2A2Q13296 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCGB2A2Q13296 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCGB2A2Q13296 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCGB2A2Q13296 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCGB2A2Q13296 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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SCGB2A2Q13296 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCGB2A2Q13296 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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SCGB2A2Q13296 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCGB2A2Q13296 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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SCGB2A2Q13296 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCGB2A2Q13296 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCGB2A2Q13296 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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SCGB2A2Q13296 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCGB2A2Q13296 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCGB2A2Q13296 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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SCGB2A2Q13296 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCGB2A2Q13296 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCGB2A2Q13296 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCGB2A2Q13296 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCGB2A2Q13296 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCGB2A2Q13296 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCGB2A2Q13296 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCGB2A2Q13296 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCGB2A2Q13296 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCGB2A2Q13296 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCGB2A2Q13296 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCGB2A2Q13296 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCGB2A2Q13296 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCGB2A2Q13296 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCGB2A2Q13296 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SCGB2A2Q13296 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCGB2A2Q13296 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCGB2A2Q13296 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCGB2A2Q13296 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCGB2A2Q13296 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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