Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RIGQ13278 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RIGQ13278 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RIGQ13278 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RIGQ13278 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RIGQ13278 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RIGQ13278 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RIGQ13278 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RIGQ13278 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RIGQ13278 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RIGQ13278 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RIGQ13278 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RIGQ13278 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RIGQ13278 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RIGQ13278 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
RIGQ13278 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RIGQ13278 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RIGQ13278 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
RIGQ13278 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RIGQ13278 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RIGQ13278 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RIGQ13278 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RIGQ13278 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RIGQ13278 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RIGQ13278 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RIGQ13278 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RIGQ13278 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RIGQ13278 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RIGQ13278 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RIGQ13278 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RIGQ13278 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RIGQ13278 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RIGQ13278 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RIGQ13278 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RIGQ13278 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RIGQ13278 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RIGQ13278 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RIGQ13278 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RIGQ13278 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RIGQ13278 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RIGQ13278 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RIGQ13278 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RIGQ13278 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RIGQ13278 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RIGQ13278 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RIGQ13278 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RIGQ13278 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RIGQ13278 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RIGQ13278 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RIGQ13278 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RIGQ13278 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RIGQ13278 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RIGQ13278 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RIGQ13278 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RIGQ13278 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RIGQ13278 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RIGQ13278 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
RIGQ13278 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
RIGQ13278 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RIGQ13278 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RIGQ13278 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RIGQ13278 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RIGQ13278 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RIGQ13278 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RIGQ13278 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RIGQ13278 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RIGQ13278 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RIGQ13278 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RIGQ13278 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RIGQ13278 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RIGQ13278 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RIGQ13278 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RIGQ13278 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RIGQ13278 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RIGQ13278 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RIGQ13278 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RIGQ13278 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RIGQ13278 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RIGQ13278 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RIGQ13278 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RIGQ13278 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RIGQ13278 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RIGQ13278 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RIGQ13278 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RIGQ13278 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RIGQ13278 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RIGQ13278 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RIGQ13278 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RIGQ13278 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
RIGQ13278 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RIGQ13278 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RIGQ13278 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RIGQ13278 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RIGQ13278 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RIGQ13278 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RIGQ13278 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
RIGQ13278 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RIGQ13278 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RIGQ13278 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RIGQ13278 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms