Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXF1Q12946 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXF1Q12946 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXF1Q12946 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXF1Q12946 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
FOXF1Q12946 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
FOXF1Q12946 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
FOXF1Q12946 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXF1Q12946 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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