Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms