Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 ST20-201ENST00000478497 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 AC099063.1-201ENST00000437128 324 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 KCNIP4-204ENST00000382150 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 MS4A6A-201ENST00000412309 1284 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 MTND2P15-201ENST00000418575 892 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 AP001528.1-201ENST00000499504 1223 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 AC104123.1-203ENST00000513158 575 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 AP000944.1-201ENST00000533886 564 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CACNB1Q02641 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms