Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms