Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms