Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF9Q00978 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms