Protein–RNA interactions for Protein: Q00056

HOXA4, Homeobox protein Hox-A4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4Q00056 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXA4Q00056 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXA4Q00056 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXA4Q00056 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXA4Q00056 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXA4Q00056 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXA4Q00056 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXA4Q00056 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXA4Q00056 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXA4Q00056 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXA4Q00056 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXA4Q00056 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXA4Q00056 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXA4Q00056 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXA4Q00056 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXA4Q00056 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXA4Q00056 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXA4Q00056 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXA4Q00056 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXA4Q00056 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXA4Q00056 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXA4Q00056 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXA4Q00056 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXA4Q00056 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXA4Q00056 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXA4Q00056 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXA4Q00056 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXA4Q00056 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXA4Q00056 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXA4Q00056 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXA4Q00056 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXA4Q00056 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXA4Q00056 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXA4Q00056 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXA4Q00056 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXA4Q00056 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXA4Q00056 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXA4Q00056 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXA4Q00056 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXA4Q00056 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXA4Q00056 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXA4Q00056 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXA4Q00056 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXA4Q00056 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXA4Q00056 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA4Q00056 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA4Q00056 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA4Q00056 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA4Q00056 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA4Q00056 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA4Q00056 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA4Q00056 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA4Q00056 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA4Q00056 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA4Q00056 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA4Q00056 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA4Q00056 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA4Q00056 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA4Q00056 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA4Q00056 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA4Q00056 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA4Q00056 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA4Q00056 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA4Q00056 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA4Q00056 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXA4Q00056 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXA4Q00056 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXA4Q00056 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXA4Q00056 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXA4Q00056 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXA4Q00056 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXA4Q00056 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXA4Q00056 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXA4Q00056 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXA4Q00056 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXA4Q00056 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXA4Q00056 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXA4Q00056 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXA4Q00056 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXA4Q00056 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXA4Q00056 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXA4Q00056 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA4Q00056 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA4Q00056 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA4Q00056 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA4Q00056 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA4Q00056 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA4Q00056 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA4Q00056 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA4Q00056 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA4Q00056 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA4Q00056 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA4Q00056 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA4Q00056 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA4Q00056 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA4Q00056 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA4Q00056 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA4Q00056 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA4Q00056 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXA4Q00056 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms