Protein–RNA interactions for Protein: P78364

PHC1, Polyhomeotic-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHC1P78364 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHC1P78364 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHC1P78364 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHC1P78364 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHC1P78364 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHC1P78364 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHC1P78364 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHC1P78364 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHC1P78364 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHC1P78364 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHC1P78364 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHC1P78364 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHC1P78364 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHC1P78364 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHC1P78364 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PHC1P78364 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PHC1P78364 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PHC1P78364 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PHC1P78364 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHC1P78364 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHC1P78364 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHC1P78364 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHC1P78364 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHC1P78364 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHC1P78364 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHC1P78364 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHC1P78364 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHC1P78364 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHC1P78364 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHC1P78364 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHC1P78364 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHC1P78364 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHC1P78364 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHC1P78364 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHC1P78364 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHC1P78364 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHC1P78364 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHC1P78364 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHC1P78364 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHC1P78364 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHC1P78364 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHC1P78364 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHC1P78364 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHC1P78364 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHC1P78364 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHC1P78364 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHC1P78364 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHC1P78364 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHC1P78364 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHC1P78364 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHC1P78364 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHC1P78364 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHC1P78364 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHC1P78364 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHC1P78364 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHC1P78364 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHC1P78364 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHC1P78364 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHC1P78364 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PHC1P78364 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHC1P78364 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHC1P78364 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PHC1P78364 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHC1P78364 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHC1P78364 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PHC1P78364 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHC1P78364 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHC1P78364 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PHC1P78364 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHC1P78364 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHC1P78364 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHC1P78364 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHC1P78364 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHC1P78364 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHC1P78364 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PHC1P78364 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PHC1P78364 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHC1P78364 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHC1P78364 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHC1P78364 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHC1P78364 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHC1P78364 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHC1P78364 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHC1P78364 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHC1P78364 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHC1P78364 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHC1P78364 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHC1P78364 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHC1P78364 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHC1P78364 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHC1P78364 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHC1P78364 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHC1P78364 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHC1P78364 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHC1P78364 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHC1P78364 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHC1P78364 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHC1P78364 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHC1P78364 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHC1P78364 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms