Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UFM1P61960 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UFM1P61960 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UFM1P61960 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
UFM1P61960 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UFM1P61960 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UFM1P61960 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
UFM1P61960 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UFM1P61960 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UFM1P61960 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UFM1P61960 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UFM1P61960 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UFM1P61960 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UFM1P61960 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UFM1P61960 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UFM1P61960 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UFM1P61960 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UFM1P61960 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UFM1P61960 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UFM1P61960 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UFM1P61960 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UFM1P61960 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UFM1P61960 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UFM1P61960 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UFM1P61960 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
UFM1P61960 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UFM1P61960 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UFM1P61960 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UFM1P61960 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
UFM1P61960 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UFM1P61960 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
UFM1P61960 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UFM1P61960 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UFM1P61960 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UFM1P61960 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UFM1P61960 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UFM1P61960 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UFM1P61960 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
UFM1P61960 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UFM1P61960 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UFM1P61960 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UFM1P61960 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UFM1P61960 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UFM1P61960 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
UFM1P61960 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UFM1P61960 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UFM1P61960 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UFM1P61960 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UFM1P61960 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UFM1P61960 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UFM1P61960 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UFM1P61960 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UFM1P61960 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UFM1P61960 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UFM1P61960 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UFM1P61960 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UFM1P61960 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UFM1P61960 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UFM1P61960 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UFM1P61960 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UFM1P61960 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UFM1P61960 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UFM1P61960 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UFM1P61960 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UFM1P61960 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UFM1P61960 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UFM1P61960 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UFM1P61960 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UFM1P61960 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UFM1P61960 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UFM1P61960 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UFM1P61960 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UFM1P61960 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UFM1P61960 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UFM1P61960 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UFM1P61960 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UFM1P61960 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UFM1P61960 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UFM1P61960 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UFM1P61960 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UFM1P61960 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UFM1P61960 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UFM1P61960 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UFM1P61960 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UFM1P61960 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UFM1P61960 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UFM1P61960 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UFM1P61960 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UFM1P61960 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UFM1P61960 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UFM1P61960 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UFM1P61960 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UFM1P61960 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UFM1P61960 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UFM1P61960 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
UFM1P61960 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UFM1P61960 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UFM1P61960 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UFM1P61960 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UFM1P61960 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms